郁金香茎直立、光滑、被白粉、翠绿色,个别品种为黄、红褐色。鳞茎盘是短缩的茎,上部着生鳞片、叶片、花芽和侧芽,底部(茎基部)月芽形突起部位生根。从而形成1个完整的个体,也叫鳞茎或种球。
郁金香的根系由每年新生的不分枝的须根组成,着生在鳞茎盘底部周围。只有种子繁育的1年生苗才生长主根,其长度在最好的环境条件下仅有6-10厘米。随年龄增长和鳞茎体积长大,其根系数量增多,成年鳞茎根系约100-150条或更多。
郁金香2-4年生鳞茎和开花鳞茎繁殖的小鳞茎具有生长芽茎的特点。芽茎是一个结构中空的器官,在芽茎顶端着生一个小的鳞茎。郁金香个别品种在适宜环境条件下,在茎基部叶腋处可生成珠芽,生长停止后发育良好的珠芽,种植后长成小鳞茎。这是百合科部分物种的特殊繁殖习性